Mérida tiene un pequeño, pero nuevo y muy organizado Terminal de autobuses, situado en la Avenida Las Américas, alrededor de 10 minutos en taxi desde el centro de la ciudad y la Posada Yagrumo. A su llegada, es aconsejable tomar un taxi afuera del Terminal, que hasta el centro, tiene un precio de alrededor de 12 bolívares.
El Terminal tiene conexiones con la mayoría de las principales ciudades en el occidente del país como Maracaibo, Coro, San Cristóbal, Barquisimeto, Barinas, y Valera; también tiene conexiones directas con las ciudades costeras centroocciodentales como Punto Fijo, Valencia, Maracay y Caracas, y por supuesto, las conexiones directas hacia Maturín, Puerto La Cruz, Cumaná y Ciudad Bolívar. El Terminal ofrece destinos locales e incluye enlaces con los autobuses que van a Lagunillas, Jají, Timotes, Apartaderos y El Vigía.
Actualmente, todos los vuelos comerciales nacionales están operando del aeropuerto de El Vigia, y existe una posibilidad que al futuro algunos vuelos llegaran directamente a la ciudad de Mérida. Si está buscando volar hacia dentro o fuera de Mérida, es preferible confirmar primero a cual aeropuerto llegara su vuelo. El Vigia está ubicado a hora de distancia desde Mérida, y tiene vuelos regulares a Caracas y Margarita. Un taxi desde El Vigía hasta Mérida cuesta aproximadamente Bs. 100.
